L'applicazione Apple Drive Setup può essere trovata nella cartella Utilities del CD di MacOS. Non riesce a modificare le partizioni esistenti, ha il limite di partizionare tutto il disco in una sola volta. Le partizioni sul disco non sono mostrate in Drive Setup. Ricordarsi di creare una partizione (preferibilmente all'inizio del disco) per tenere il posto a GNU/Linux. Il tipo di questa partizione non è importante, in seguito verrà cancellata e sostituita dal programma d'installazione di &debian;. Se si sta preparando l'installazione di MacOS 9 e OS X, si consiglia di creare delle partizioni separate per OS 9 e OS X. Infatti se sono installati nella stessa partizione, si deve usare ogni volta Startup Disk per selezionare quale dei due attivare; la scelta fra i due sistemi non può essere fatta all'avvio. Usando delle partizioni separate per OS 9 e OS X si può scegliere quale avviare tenendo premuto il tasto option e si possono anche inserire nel menu di yaboot. Inoltre, Startup Disk declassa tutte le altre partizioni e quindi può avere degli effetti sull'avvio di GNU/Linux. Le partizioni per OS 9 e OS X saranno accessibili da entrambi i sistemi. GNU/Linux non è in grado di accedere alle informazioni su partizioni UFS, però supporta le partizioni HFS+ (note come MacOS Extended). OS X richiede uno di questi due tipi per la propria partizione di avvio. MacOS 9 può essere installato su partizioni HFS (note come MacOS Standard) o HFS+. Per condividere informazioni fra sistemi MacOS e GNU/Linux è necessaria una partizione di scambio. Le partizioni HFS, HFS+ e MS-DOS FAT sono supportate da MacOS e Linux.