Macchine S/390 e zSeries A partire da Debian Squeeze, il supporto per l'avvio in modalità ESA/390 è stato rimosso. La macchina deve supportare almeno la z/Architecture, Architecture Level Set 2. Lo spazio utente è ancora compilato per ESA/390. Tutto l'hardware zSeries è completamente supportato. Il supporto software per &arch-title; è incluso dal kernel 2.6.32 di sviluppo. Informazioni più aggiornate sul supporto IBM a Linux possono essere trovate nella pagina Linux su System z di developerWorks.