Il principale metodo che si usa per installare i pacchetti sul proprio sistema è il programma chiamato apt-get, dal pacchetto apt Notare che il vero programma che installa i pacchetti si chiama dpkg. Comunque questo pacchetto è qualcosa di più di uno strumento di basso livello. apt-get è uno strumento di livello più elevato che richiamerà dpkg nel modo dovuto, sia perché sa come installare altri pacchetti che siano richiesti dal pacchetto che si sta tentando di installare, sia perché è anche capace di recuperare il pacchetto nel CD, la rete od in qualche altro posto. . Altre interfacce per la gestione dei pacchetti come aptitude, synaptic ed il più vecchio dselect impiegano e dipendono da apt-get. Queste interfacce sono consigliabili ai nuovi utenti poiché integrano alcune altre caratteristiche (ricerca dei pacchetti e verifica dello stato) in un'interfaccia utente gradevole. APT deve essere configurato per sapere dove recuperare i pacchetti. L'applicativo ausiliario che collabora a questo compito si chiama apt-setup. Il prossimo passo nel processo di configurazione consiste nel dire ad APT dove possono essere trovati gli altri pacchetti Debian. Notare che questo strumento può venire riavviato in qualunque momento dopo l'installazione avviando apt-setup, o modificando manualmente /etc/apt/sources.list. A questo punto, se c'è un CD-ROM ufficiale nel lettore, questo CD-ROM verrà configurato automaticamente come sorgente apt senza alcun comando. Si potrà capire ciò vedendo che il CD-ROM viene scandito. Agli utenti sprovvisti di CD-ROM ufficiali vengono indicati molti modi per accedere ai pacchetti Debian: FTP, HTTP, CD-ROM, od un file system locale. Si deve sapere che è perfettamente accettabile avere diverse sorgenti APT, anche per lo stesso archivio Debian. apt-get preleverà automaticamente il pacchetto con il numero di versione più alto, date tutte le versioni disponibili. Oppure, ad esempio, se si avesse sia una sorgente APT HTTP che una su CD-ROM, apt-get potrebbe impiegare automaticamente il CD-ROM locale quando possibile, e ricorrere ad HTTP solo se lì ci fosse una versione più recente. Comunque non è una buona idea aggiungere sorgenti APT non necessarie, poiché la verifica dell'esistenza di nuove versioni negli archivi di rete tende a rallentare il processo. Se si intende installare la parte restante del sistema attraverso la rete la possibilità più comune è di selezionare la sorgente http. La sorgente ftp è parimenti accettabile ma tende talvolta ad essere più lenta nelle connessioni. Il prossimo passo nella configurazione delle sorgenti per i pacchetti in rete consiste nel dire ad apt-setup in quale paese si risieda. Ciò configura i mirror Debian ufficiali su internet a cui connettersi. A seconda del paese prescelto viene mostrato un elenco di server disponibili. In genere è meglio prenderne uno in cima all'elenco, ma tutti dovrebbero funzionare. Notare comunque che l'elenco dei mirror fornito nel corso dell'installazione è stato generato nel momento in cui era stato rilasciato Debian ed alcuni di essi potrebbero non essere più disponibili. Dopo avere scelto un mirror verrà chiesto se si debba usare un server proxy. Un server proxy è un server che inoltra tutte le richieste HTTP e/o FTP ad internet e viene spesso usato per regolare ed ottimizzare gli accessi ad internet su delle reti aziendali. In alcune reti soltanto il server proxy può accedere ad internet, in questo caso dovrà essere inserito il nome del server proxy. Si potrebbe dover includere un nome utente ed una password. La maggior parte degli utenti di casa non avrà necessità di specificare il nome di un server proxy, sebbene alcuni ISP possano fornire dei server proxy ai propri utenti. Dopo avere selezionato un mirror, la nuova sorgente di pacchetti sulla rete verrà verificata. Se tutto è andato bene, verrà chiesto se si desidera aggiungere un'altra sorgente di pacchetti. Se ci fossero problemi ad impiegare la sorgente di pacchetti che si è scelta, si provi ad usare un mirror differente (o preso dall'elenco riferito al vostro paese o da quello mondiale), oppure provare ad usare una diversa sorgente di pacchetti dalla rete.