Le principal outil utilisé pour installer des paquets sur les systèmes Debian est un programme appelé apt-get qui se trouve dans le paquet apt Notez que le programme effectivement utilisé pour installer des paquets est dpkg. Toutefois, ce paquet est un outil de bas niveau qu'apt-get appelle lorsqu'il en a besoin. Ce dernier est un outil de plus haut niveau car il sait aussi bien installer les paquets nécessaires à l'installation du paquet que vous essayez d'installer, que récupérer le paquet à partir d'un cédérom, du réseau, etc. Il sait aussi installer automatiquement les paquets nécessaires au bon fonctionnement des paquets qu'il installe.. D'autres paquets, comme aptitude, synaptic ou l'ancien dselect dépendent d'apt et l'utilisent. Ces programmes de gestion des paquets, avec de belles interfaces utilisateur, offrent des fonctions supplémentaires comme la recherche de paquets ou la vérification des statuts. Le programme aptitude est maintenant recommandé pour la gestion des paquets. Apt doit être configuré pour qu'il sache où récupérer les paquets. L'installateur prend en charge cela automatiquement en fonction des informations contenues sur le support d'installation. Les résultats de cette configuration sont écrits dans le fichier /etc/apt/sources.list. Vous pouvez le consulter et le modifier à votre guise quand l'installation est terminée.