Si vous utilisez AmigaOS, vous pouvez vous servir du programme HDToolBox pour partitionner votre disque avant l'installation. Les identificateurs de partition pour Atari sont formés de trois caractères ASCII. Utilisez LNX pour les données et SWP pour les partitions d'échange. Si vous utilisez une méthode d'installation pour machine avec peu de mémoire, une petite partition Minix est aussi nécessaire (environ 2 Mo), pour laquelle l'identificateur est MNX. Une erreur dans la configuration des identificateurs des partitions empêche non seulement l'installateur de Debian de reconnaître les partitions, mais fait aussi que le système d'exploitation essaye d'utiliser les partitions Linux, ce qui perturbe le contrôleur de disque et rend tout le disque inutilisable. Il y a de nombreux outils de partitionnement disponibles (les outils harddisk propres à Atari ne permettent pas de changer les identificateurs de partitions) ; ce manuel ne peut pas donner de description détaillée pour chacun. La description ci-dessous ne concerne que SCSITool (de Hard+Soft GmBH). Démarrez SCSITool et choisissez le disque que vous voulez partitionner (menu Disk, choix select) ; À partir du menu Partition, choisissez soit New pour ajouter de nouvelles partitions ou changer la taille des partitions existantes, soit Change pour changer une partition spécifique. Sauf si vous avez déjà ajouté de nouvelles partitions avec la bonne taille et voulez seulement changer les identificateurs, New est certainement le meilleur choix ; Pour l'option New, choisissez existing dans la boîte de dialogue qui demande les paramètres initiaux. La fenêtre suivante donne des informations détaillées sur l'emplacement des partitions existantes ; la première colonne de cette liste indique le type de la partition. Vous pouvez le modifier en cliquant sur le champ du texte. Sauvez les changements en quittant la fenêtre avec le bouton OK ; Pour l'option Change, choisissez la partition à modifier dans la liste de sélection, et choisissez other systems dans la boîte de dialogue. La fenêtre suivante donne des informations détaillées sur l'emplacement de cette partition, et permet d'en changer l'identificateur. Sauvez les changements en quittant la fenêtre avec le bouton OK ; Inscrivez les noms Linux pour chacune de ces partitions qui seront utilisées avec Linux — voir  ; Quittez SCSITool avec le choix Quit du menu File. L'ordinateur va redémarrer pour s'assurer que la nouvelle table de partitions sera prise en compte par le système d'exploitation. Si vous avez modifié des partitions pour le système d'exploitation (TOS) ou l'environnement graphique (GEM), elles seront rendues inopérantes et devront être réinitialisées ; nous vous avions prévenus qu'il fallait faire une sauvegarde, n'est-ce-pas ? Il y a un outil de partitionnement pour Linux/m68k appelé atari-fdisk dans le système d'installation, mais pour l'instant nous vous recommandons de partitionner votre disque en utilisant un éditeur de partition TOS ou tout autre utilitaire disque. Si votre éditeur de partition ne dispose pas d'option pour changer le type de partition, vous pourrez faire cette étape cruciale à un moment différent (à partir du RAMdisk au démarrage de l'installation). SCSITool n'est qu'un des éditeurs de partition qui supportent la sélection de type quelconque de partitions. Il y en a d'autres, choisissez celui qui vous convient. Les outils de partitionnement pour Macintosh que nous avons testés sont pdisk, HD SC Setup 7.3.5 (Apple), HDT 1.8 (FWB), SilverLining (LaCie) et DiskTool (Tim Endres, GPL). Des versions complètes sont nécessaires pour HDT et SilverLining. L'utilitaire d'Apple nécessite un correctif pour reconnaître des disques étrangers (un descriptif expliquant comment corriger HD SC Setup avec ResEdit peut être trouvé sur ). Pour des Macs IDE, vous devez utiliser l'application Apple Drive Setup pour libérer de la place pour les partitions Linux, puis poursuivez le partitionnement sous Linux, ou utilisez la version MacOS de pdisk disponible sur le serveur FTP de MkLinux.