/biology/

• ../
• Makefile
• abyss
• ad2vcf
• artemis
• avida
• babel
• bamtools
• bbmap
• bcftools
• bedtools
• bioawk
• biococoa
• biolibc
• bioparser
• biosoup
• bolt-lmm
• bowtie
• bowtie2
• bwa
• canu
• cd-hit
• cdbfasta
• checkm
• clustal-omega
• clustalw
• cufflinks
• cytoscape
• ddocent
• diamond
• dsr-pdb
• edlib
• emboss
• exonerate
• fasta
• fasta3
• fastahack
• fastdnaml
• fastool
• fastp
• fastqc
• fasttree
• fastx-toolkit
• figtree
• fluctuate
• freebayes
• garlic
• gatk
• gcta
• gemma
• generand
• gff2ps
• gmap
• gperiodic
• graphlan
• groopm
• haplohseq
• hhsuite
• hisat2
• hmmer
• htslib
• hyphy
• igv
• infernal
• iolib
• iqtree
• jalview
• jellyfish
• kallisto
• lamarc
• libbigwig
• libgtextutils
• libsbml
• linux-foldingathome
• mafft
• mapm3
• migrate
• minimap2
• molden
• mopac
• mothur
• mrbayes
• mummer
• muscle
• ncbi-blast+
• ncbi-cxx-toolkit
• ncbi-entrez-direct
• ncbi-toolkit
• ncbi-vdb
• ngs-sdk
• p5-AcePerl
• p5-Bio-ASN1-EntrezGene
• p5-Bio-Cluster
• p5-Bio-Coordinate
• p5-Bio-DB-EMBL
• p5-Bio-DB-NCBIHelper
• p5-Bio-Das-Lite
• p5-Bio-Das
• p5-Bio-FeatureIO
• p5-Bio-GFF3
• p5-Bio-Glite
• p5-Bio-Graphics
• p5-Bio-MAGETAB
• p5-Bio-NEXUS
• p5-Bio-Phylo
• p5-Bio-SCF
• p5-Bio-Variation
• p5-BioPerl-Run
• p5-BioPerl
• p5-TrimGalore
• p5-transdecoder
• paml
• pbbam
• pbseqan
• pear-merger
• phrap
• phred
• phyml
• picard-tools
• plink
• pooler
• primer3
• prodigal
• prodigy-lig
• protomol
• psi88
• py-Genesis-PyAPI
• py-bigwig
• py-biom-format
• py-biopython
• py-bx-python
• py-crossmap
• py-cutadapt
• py-dnaio
• py-ete3
• py-gffutils
• py-gtfparse
• py-hits
• py-loompy
• py-macs2
• py-multiqc
• py-orange3-bioinformatics
• py-orange3-single-cell
• py-pandas-charm
• py-pyfaidx
• py-pysam
• py-resdk
• py-scikit-bio
• py-xenaPython
• pyfasta
• python-nexus
• rainbow
• rampler
• readseq
• recombine
• ruby-bio
• rubygem-bio-executables
• rubygem-bio-old-biofetch-emulator
• rubygem-bio-shell
• rubygem-bio
• samtools
• scrm
• seaview
• seqan-apps
• seqan
• seqan1
• seqan3
• seqio
• seqkit
• seqtk
• sim4
• slclust
• smithwaterman
• snpeff
• spoa
• stacks
• star
• stringtie
• subread
• tRNAscan-SE
• tabixpp
• treekin
• treepuzzle
• trimadap
• trimmomatic
• ucsc-userapps
• ugene
• vcf-split
• vcf2hap
• vcflib
• vcftools
• velvet
• viennarna
• vsearch
• vt
• wise